根据海洋生物的不同，取样方法可以分为以下四类：

1）浮游生物：鱼类、乌贼类等浮游生物。

2）底栖生物：贝类、甲壳类、海参类、海星类、海胆类、海绵类底栖生物。

3）海藻类：裙带菜、羊栖菜、石花菜、苔菜、马尾藻、黑海带、褐海带等海藻类。

4）附着生物：淡菜类、牡蛎、海鞘等生息在岩石礁石上的生物。

采集部位

全体或可食部分，或者内脏、肌肉等，根据目的不同，采集不同部位。

采集量同淡水生物。

采集用具

一般做法是委托取样，然后购入。但必须交待和记录清楚具体要求。若自行取样也得取得相关部门同意和协助。可采用的工具有：

底栖生物：拖网。

海藻类、附着生物：刮土机、钢凿。

采集方法

浮游生物：在捕鱼期，随鱼种而定。若委托取样，需交待清楚必须详细记录的内容。

底栖生物：海星类生物需雇用拖网采集。海滨岩石上未利用的贝类，采用凿石钢凿和刮刀。海藻类：一般委托他人采集，需交待清楚必须详细记录的内容。

附着生物：一般委托他人采集，需交待清楚必须详细记录的内容。

预处理

a）浮游生物：采集到的样品尽量在其新鲜时迅速用净水洗净。其余同淡水生物。b）底栖生物、附着生物：同淡水生物。

c）海藻类：海藻类多数附着在其他动植物上。另外，藻类根部上常常容易附着岩石碎片等杂物， 所以要注意把它们除去。用作指示生物时，要直接进行控水。控水以后，称样品重量（鲜重）。